MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Amycolatopsis mediterranei S699 chromosome

Total Repeats: 25046

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
25001	NC_017186	TCC	2	6	10225079	10225084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25002	NC_017186	GAG	2	6	10225316	10225321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25003	NC_017186	CCA	2	6	10226512	10226517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25004	NC_017186	CG	3	6	10226535	10226540	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25005	NC_017186	CTT	2	6	10226612	10226617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25006	NC_017186	CCCGG	2	10	10228911	10228920	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
25007	NC_017186	ATC	2	6	10229973	10229978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25008	NC_017186	ATC	2	6	10230011	10230016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25009	NC_017186	CCT	2	6	10231981	10231986	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25010	NC_017186	GGT	2	6	10232005	10232010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25011	NC_017186	CTC	2	6	10232739	10232744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25012	NC_017186	CCG	2	6	10232747	10232752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25013	NC_017186	GCCG	2	8	10232841	10232848	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25014	NC_017186	CCG	3	9	10232846	10232854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25015	NC_017186	CA	3	6	10233432	10233437	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25016	NC_017186	CAGAA	2	10	10233480	10233489	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
25017	NC_017186	TCTCC	2	10	10234054	10234063	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
25018	NC_017186	CGGG	2	8	10235624	10235631	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
25019	NC_017186	CCGG	2	8	10235640	10235647	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25020	NC_017186	CGA	2	6	10235654	10235659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25021	NC_017186	CGA	2	6	10235723	10235728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25022	NC_017186	CGG	2	6	10235729	10235734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25023	NC_017186	CGG	2	6	10235761	10235766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25024	NC_017186	CGG	2	6	10235805	10235810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25025	NC_017186	ACC	2	6	10235826	10235831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25026	NC_017186	CAC	2	6	10235852	10235857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25027	NC_017186	GCC	2	6	10235871	10235876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25028	NC_017186	GAC	2	6	10235921	10235926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25029	NC_017186	GGC	2	6	10235929	10235934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25030	NC_017186	GCCT	2	8	10235935	10235942	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
25031	NC_017186	CCG	2	6	10235984	10235989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25032	NC_017186	GCA	2	6	10236007	10236012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25033	NC_017186	GC	3	6	10236015	10236020	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25034	NC_017186	CGGC	2	8	10236023	10236030	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25035	NC_017186	CCCG	2	8	10236212	10236219	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
25036	NC_017186	CTT	2	6	10236231	10236236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25037	NC_017186	ACG	2	6	10236302	10236307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25038	NC_017186	CGA	2	6	10236310	10236315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25039	NC_017186	CCGG	2	8	10236419	10236426	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25040	NC_017186	GCC	2	6	10236490	10236495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25041	NC_017186	CT	3	6	10236536	10236541	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25042	NC_017186	GTG	2	6	10236574	10236579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25043	NC_017186	ACG	2	6	10236596	10236601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25044	NC_017186	GGT	2	6	10236610	10236615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25045	NC_017186	CGA	2	6	10236755	10236760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25046	NC_017186	GGGGA	2	10	10236761	10236770	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.